Aktivitet: Andre aktivitetstyper › Undervisningsforløb
Beskrivelse
I forløbet arbejdes der med data fra sekventering af genomer og transkriptomer med eksempler på sekventeringsplatforme og prøvematerialer. Herunder arbejde med kvalitetssikring af sekventeringsdata via analyse af MultiQC og FastQC rapporter. Hands on optimering af sekventeringsdatasæt eksempelvis via trimming af adaptorsekvens. Applikationer: Klinisk mikrobiologiske anvendelser af genomdata og udvikling af personalig medicin i epilepsi. Bioinformatisk vurdering af mRNA fra hjernevævsprøver fra epilepsipatienter. Præanalytisk kvalitet af prøvemateriale forud for transkriptomanalyse. Dataformater og filtyper.